XML為目前最主要的資料交換及表示標準格式之ㄧ,因此,XML 格式的資料近年來快速的成長,而資料探勘技術能幫助我們分析這些大量XML資料,找出其中有價值的資訊。在生物資訊領域中,許多資料庫也已提供XML交換格式,如能將這些XML生物資料進行整合與探勘,可使生物資訊更為全面,擴大其應用範圍。所以本篇論文提出整合了各類蛋白質XML資料的方法,並根據資料中的結構階層對蛋白質進行各類關聯法則探勘,最後探勘出的關聯法則也包含了XML資料語意描述及共有結構特性。 As the fast increasing of XML data, data mining techniques can discover valuable rules behind these large amounts of data. There are many biological databases which provide XML data for data interchanging purpose. If we can integrate these biological XML